Genome Biology透明同行评议试行中
作为第一批开放获取期刊，Genome Biology （基因组生物学）自2000年创刊以来，一直对开放研究政策保持极大的热情，例如，我们是最早要求作者公开全部支持数据及开放源代码的期刊之一。因此，当其他期刊逐渐开始尝试、甚至一些期刊已经全面推行透明同行评议或公开同行评议时，我们一直保持着密切关注。
这方面的一些先驱包括《英国医学杂志》（British Medical Journal）和BMC系列期刊。前者在1999年就采用了公开同行评议，而后者自创刊起就一直采用公开同行评议。Elife杂志也一直推崇透明同行评议的方式。在征得作者同意后，Elife杂志会一同刊登编辑决定信与作者回复。《自然-通讯》（Nature Communications）从2016年1月开始试行透明同行评议，平均约60%的作者都自愿选择了发表论文的同行评议记录。
从2017年9月11-17日的同行评议周开始，我们决定试行透明同行评议。
透明同行评议，即评议者保持匿名，但当文章被接收后，评议报告会与最终的文章一同发表。公开同行评议，即评议报告公开发表的同时也会公布评议者姓名。这两种方式都能增加同行评议过程的责任感。
公开同行评议还提供了一种使评议者通过评议过程中的付出来提升自己的业界声望的途径。更进一步说，当评议者知道他们的报告会被发表时，往往也会提供更具建设性的意见。基于这些原因，我们发现科研工作者们也越来越欢迎公开的学术环境：越来越多的评议者开始选择在他们的评议报告上署名，这一点在生物信息学领域尤其明显。
不过，还有很多其他的作者认为，完全公开的同行评议所带来的风险大于益处。其经常提到的一个问题是，处于职业生涯起步阶段的青年研究者很可能会不愿意批评同领域内资深研究者的工作，因为他们担心这会对其未来科研经费的申请或自身文章的同行评议带来负面影响。这种情况将可能导致评议报告隐瞒一些有价值的批评建议，从而大打折扣；或者导致愿意参与评议的人变少，于是同行评议花费的时间更长。
这样看来，透明同行评议制度，一方面保留了公开评议的优点，另一方面通过保持评议者的匿名状态，从而解决了公开评议的一些问题。事实也的确如此，《自然-通讯》在试行期间发现大部分作者都更愿意选择透明评议。
在明确了这些优缺点后，我们在自己的编辑委员会中进行了一项调查，来征求他们关于同行评议开放性的意见。一小部分（38%，13/34）委员会成员赞成完全公开评议；基本上赞同公开，但还有些保留意见或不确定的成员比例稍高一些（47%，16/34）。收到最多的建议是评议报告应该公开发表，但应保持评议者匿名（而不是署上评议者的名字）。
由此Genome Biology决定开始试行透明同行评议。我们将分析试行期间学术界对这种方式的支持程度，以及这种方式对同行评议时间的影响。半数同行评议文章将试行透明同行评议，另外半数文章则作为对照组。对于试验组的文章，作者可以自主选择透明同行评议或传统的单盲评议。我们暂时不推行完全公开评议，但会让评议者自主选择是否愿意公开其身份。
我们会跟踪并记录透明评议试验中，从开始评议到最终给作者反馈决定所花费的时间，并与对照组进行比较。尽管评议报告的质量比较难以衡量，但我们也会关注透明同行评议对评议报告质量的影响。在未来几周内，我们会明确透明同行评议是否会延长评议时间，以及我们的作者与评议者团体对永久采用透明同行评议方式的接受程度。
试验目前依旧在进行中，我们会在未来的几个月内公布结果。如果您有对此有任何意见，请通过以下邮箱与我们联系：editorial@genomebiology.com。
声明
作者贡献
Andrew Cosgrove通过讨论并综合了Louisa Flintoft的意见完成了这篇文章，两位作者均认可了最终版本。
利益冲突
两位作者均为Genome Biology的编辑，受雇于SpringerNature。
开放获取
本文遵循《知识共享署名国际许可4.0》(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)的规定，在保留原作者信息及标明文章来源，并提供知识共享署名许可链接的前提下，允许自由使用、传播和任何形式的复制。如有改动，需要注明。除非另行声明，公共领域知识共享豁免条款(http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)适用于本文中提供的数据。
Genome Biology|doi:10.1186/s13059-017-1314-z
长按并提取二维码浏览BMC期刊列表
点击“阅读原文”阅读英文原文
BMC是施普林格∙自然旗下机构。作为开放获取出版先锋，BMC不断推出一系列高质量的同行评议期刊，包括BMC Biology 、BMC Medicine等涵盖范围较广的期刊，以及Malaria Journal、Microbiome和BMC系列期刊等专门刊物。BMC以“科研永不止步”为信条，致力于不断创新，以更好地满足作者群体的需要，确保所发表论文的完整性，并积极推广开放研究。